过程中supergene.phy和fasttree.nwk都可以生成,但利用ggtree.r -t fasttree.nwk -f $GROUP -g Group -n fasttree构建进化树就开始报错,邱老师解答:
建议用我们的docker镜像分析数据,避免软件安装错误导致报错;
进化树可视化可以用很多软件可以完成,evolview:https://www.omicsclass.com/article/963,iTOL:https://www.omicsclass.com/article/1742等
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这个就是按照咋们提供的软件进行分析的,奇怪的是其他的数据都可以,唯独这个数据提出来了这个问题,说是什么版本问题