你这个不是染色体，是contig，这些短的contig组装不可靠可以删除一下；
10 SeparateChromosomes2划分连锁群不合理怎么解决
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我分析的群体是果树的F1，具有25条染色体，因此我想要分成25个连锁群。利用zcat p.call.gz | java -cp /mnt/e/QTL/20240813HLVCF/my_genetic_map/01.PrepareData/Lep-MAP/bin SeparateChromosomes2 sizeLimit=30 numThreads=10 data=- lodLimit=$lod usePhysical=1 0.000000000001 > LOD.$lod.map 2> LOD.$lod.log
done将2000多个（总计4000多个bin）bin能划分为25个连锁群，且进一步查看不同染色体之间划分是否合理发现，同一条染色体上的bin划分在各种不同的连锁群。这个问题该怎么解决呢。
