SNP数据统计

老师,群体遗传中使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l查看不同样品共获得多少SNP,那如何查看每个样品各自拥有多少SNP呢?在该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP,但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP总数不一致,那SNP总数应该按哪个计算呢?

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  • 叶雪儿 提出于 2024-08-18 23:49

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