基因家族分析数据准备

基因家族数据准备中,运行到保留蛋白编码基因这一步时运行完检查文件protein_coding.gff3,发现有些基因好像后面不是gene_biotype,这对后面的分析有影响吗?还是需要改一下代码attachments-2024-08-7jVgQUwc66c6b10f0fb9d.png

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2 个回答

rzx

可以在保留蛋白编码基因这一步时将--attribute biotype选项中biotype改成gbkey;--value protein_coding选项中protein_coding改成mRNA。尝试一下对原始gff文件过滤。你现在应该是没有完成过滤,protein_coding.gff3文件中还有非编码蛋白

不过这不影响后续分析。可以直接进行后续分析

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御坂妹110

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  • 御坂妹110 提出于 2024-08-22 11:32

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