请问如何对muscle比对之后得到的结果进行手动调整呢?比如这种,试着调整了一下,第一次粗暴的将WRKY中间一条横杠去掉,结果报错ERROR: The sequences in the input alignment should be aligned in order to us,第二次将结构域中阶所有横杠去掉了没有报错,但是WRKYGQK结构域只显示R且前移了位置,如图,请问如何修改才能将这条序列的结构域比对得上其他序列的结构域位置啊,麻烦老师说详细点可以吗,谢谢
根据多序列比对图,将对应的字母放到对应的位置。也就是,你看其他基因在序列那个位置上有WRKYGQK,就把这个基因上的WRKYGQK放到对应位置。不是简单的对结构域中间横杠去掉。同时保证所有比对序列长度一致,缺失位置都用-填充