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老师您好,我在参考基因组建立索引时,系统报错说有1700个基因区域没有ORF,但是我的参考基因组和注释文件都是从文献链接里下载的,不知是否会影响我的后续关于群体进化的分析呢?
参考基因组
建立索引
ANNOVAR
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分类:
重测序
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omicsgene
- 生物信息
2024-09-23 10:14
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
基因组注释的不好,注释的基因不完整,可以忽略这些警告;
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啊呀。
提出于 2024-09-20 16:25
相似问题
结构变异结果各个信息都代表什么,缺失和插入位点如何查看呢
1 回答
老师好,请问一下为什么annovar注释完下图所示第1列与最后两列的突变信息不一致啊,网上很多教程我看也有这个问题似乎,所以比如第一行核苷酸到底是什么突变成什么了呢?谢谢!
1 回答
VCF注释
2 回答
Error running system command: </biosoft/annovar/2018Apr16/table_annovar.pl /work/my_reseq/5.var_ann/snp.avinput /work/my_reseq/ref -buildver unknown -outfile /work/my_reseq/5.var_ann/snp -remove -protocol refGene -operation g -nastring . -otherinfo>
1 回答
annovar注释疑惑
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