在用gemma进行亲缘关系矩阵计算时，已经給fam文件添加表型但还是报错

命令：/data/soft/gemma/gemma-0.98.5-linux-static-AMD64 -bfile /wtmp2/user049/yushiyan/prune_/alleledphwemafmissing_LDfiltered.snps -gk 2 -p /wtmp2/user049/yushiyan/-P/pheno.txt -o /wtmp2/user049/yushiyan/kinship/result.kinship_n21

ERROR: Enforce failed for number of analyzed individuals equals 0. in src/param.cpp at line 2075 in ProcessCvtPhen 【由于分析的个体数等于0，强制失败。在ProcessCvtPhen中第2075行的src/param.cpp中】

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2 个回答

丽丽莉莉 2024-12-16 20:36

您好，我也遇到了同样的问题，请问你解决了吗

奇·ꦿ໊ོ 6天前

新建一个表型文件，如果是一个表型，只需要一列，多个表型多列，不需要样品列和ID行。计算gk时，使用-p参数添加表型文件计算

在用gemma进行亲缘关系矩阵计算时，已经給fam文件添加表型但还是报错

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