老师,我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入,但是在将gvcf转换成vcf时,发现在Lc2Ns染色体就结束完成了,这是正常现象嘛,是我使用的近源种参考基因组的原因嘛?我的是简化基因组测序的

attachments-2024-10-0qt46pit671a6d1dd4186.pngattachments-2024-10-H4NSfKC1671a6d24a4375.png

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

看看结果吧,结果的VCF里面染色体是不是全的,你看看的;

有些特别短的scaffold可能就是没有SNP的;

请先 登录 后评论