差异比较分组有问题,需要调试代码看看才行;
运行core_pan_gene_compare.r ,报错Error in contrasts<-(*tmp*, value = contr.funs[1 + isOF[nn]]) : contrasts can be applied only to factors with 2 or more levels Calls: aov ... model.matrix.terms -> model.matrix.default -> contrasts<- Execution halted。我在泛基因组分类的时候只分为了3类,core, dispensable和private。是这个原因导致的报错吗?还是其他的原因?如何修改脚本?core_pan_gene_compare.r