泛基因组核心基因和可变基因长度比较core_pan_gene_compare.r报错

运行core_pan_gene_compare.r ,报错Error in contrasts<-(*tmp*, value = contr.funs[1 + isOF[nn]]) : contrasts can be applied only to factors with 2 or more levels Calls: aov ... model.matrix.terms -> model.matrix.default -> contrasts<- Execution halted。我在泛基因组分类的时候只分为了3类,core, dispensable和private。是这个原因导致的报错吗?还是其他的原因?如何修改脚本?core_pan_gene_compare.rattachments-2024-12-fMT8YUkI674d8fe24a9c3.png

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

差异比较分组有问题,需要调试代码看看才行;

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  • Q_C 提出于 2024-12-02 18:46

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