基因家族分析时,提取cds与pep序列报错显示 no sequence

Error, no sequence for Scaffold1 at /share/work/biosoft/TransDecoder/latest/util/gff3_file_to_proteins.pl line 84.

应该如何解决?代码与报错如下,

attachments-2024-12-Lwsv4CVj67618bec45573.png

我的基因组gff文件是这样的,我看课程示例文件是ID=XX;Parent=xx,是因为这个才提取不出来吗
attachments-2024-12-eBJD2uB86762635b702c2.png

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1 个回答

rzx

看一下数据文件,是不是染色体序列文件里没有Scaffold1序列,gff文件里有Scaffold1序列的注释信息,导致报错

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