老师好！之前文献报道基因组大小为3G左右，文献是组了两个单倍型基因组，每套单倍型的基因组大小为1.5G左右。目前我们又测了几个品种，按照单倍型单套基因组大小估计的每个品种测序50G，大约30×，目前用hifi数据组装了最初版基因组，组出来的基因组偏大，再怎么处理呢？文献中的图表如下
进行自比对去除冗余、blast去除细胞器的组装，如果大小还是没到预期标准可以采用purge_dups进行过滤：GitHub - dfguan/purge_dups: haplotypic duplication identification tool
不太清楚两个单倍型差异如何。如果两个单倍型差异较大，你直接用hifi组装的话会导致基因组偏大。
进行自比对去除冗余、blast去除细胞器的组装，如果大小还是没到预期标准可以采用purge_dups进行过滤：GitHub - dfguan/purge_dups: haplotypic duplication identification tool
不太清楚两个单倍型差异如何。如果两个单倍型差异较大，你直接用hifi组装的话会导致基因组偏大。