KEGG富集分析

老师我在做KEGG富集分析的时候,用了459个下调的差异基因进行富集,结果得到的通路P值都>0.05,老师这种情况会发生吗?原因是什么,我要怎么样调整参数才能得到p值小于0.05的通路?

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

这个没法调整,你可以试试输入通路试试,比如 GO,REACTOME等;如果还是没有说明你的差异分组没有通路富集;

或者换一种富集方法,GSEA富集方法;

请先 登录 后评论