老师我在做KEGG富集分析的时候,用了459个下调的差异基因进行富集,结果得到的通路P值都>0.05,老师这种情况会发生吗?原因是什么,我要怎么样调整参数才能得到p值小于0.05的通路?
这个没法调整,你可以试试输入通路试试,比如 GO,REACTOME等;如果还是没有说明你的差异分组没有通路富集;
或者换一种富集方法,GSEA富集方法;
如果觉得我的回答对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!