3 在进行转录组分析时,在自己的服务器上怎么使用以下命令,请老师帮忙解答;(没有root权限,docker镜像用不了,想在外部自己的服务器中使用)

agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl;agat_sp_keep_longest_isoform.pl

请先 登录 后评论

1 个回答

rzx

这两个脚本没有在scripts文件夹下的话,就是打包到了docker镜像里了。可以通过在镜像里面提取这个脚本,然后复制到自己服务器上去使用。不过有些软件脚本写的复杂,不是简单复制即可运行,复杂的软件会有很多依赖简单复制不一定能运行,需要按要求安装软件才能正常运行。比如安装 AGAT这个软件;不会安装直接使用我们的云服务器,可以运行docker:https://study.omicsclass.com/index

attachments-2024-12-LGX0IVFe676a25ed317a5.png为避免分析环境出现报错。还是建议在我们提供的镜像里面进行分析


请先 登录 后评论