我正在用ont数据组装植物线粒体,我想知道11.smartdenovo.sh中组装完成后挑选contigs的标准是什么?ont数据在组装前需要校正吗?
ONT进行组装前建议矫正。11.smartdenovo.sh中完成组装之后,和近缘物种的线粒体序列进行blast,选择比对次数较多的contig进行后续分析。