线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么?

我正在用ont数据组装植物线粒体,我想知道11.smartdenovo.sh中组装完成后挑选contigs的标准是什么?ont数据在组装前需要校正吗?


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1 个回答

Ti Amo

ONT进行组装前建议矫正。11.smartdenovo.sh中完成组装之后,和近缘物种的线粒体序列进行blast,选择比对次数较多的contig进行后续分析。

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  • 陈黑手 提出于 2025-01-02 20:49

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