老师，别人发的一篇泛基因组文章，应该是从头组装构建的，每个基因组对于参考基因组的SV，是不是用他们这个SV文件就可以合成图谱，就是一堆SV怎么搞成线性化，跟正常基因组一样的，作为一个参考基因组，这个是可行的吗，如何操作 - 组学大讲堂问答社区

老师，别人发的一篇泛基因组文章，应该是从头组装构建的，每个基因组对于参考基因组的SV，是不是用他们这个SV文件就可以合成图谱，就是一堆SV怎么搞成线性化，跟正常基因组一样的，作为一个参考基因组，这个是可行的吗，如何操作

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omicsgene - 生物信息 2025-03-28 13:17

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可行的，但是操作起来比较麻烦。建议自己从头构建吧

泛基因组构建有课程见：https://bdtcd.xetlk.com/s/lIqL9

Connie 5天前

您好，所以要用的SV的vcf文件不是每个基因组对于参考基因组的SV吗？

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Oho 提出于 2025-03-27 20:31