通过verkko v2.2.1版本进行基因组组装后,直接生成了挂载好的genome.fa文件,但是里面有些染色体需要手动调整,我如何区生成.hic和.assembly文件,我看教程里似乎要组装后genome.fa文件进行与hic数据的比对,但是verkko的组装结果文件里似乎没有这个文件?
verkko组装结果里没有这个,需要你自己用HiC数据比对到基因组上,然后生成.hic和.assembly文件