Hic挂载时 K值选择

我的物种染色体数目为2n=24,在划分contig成group这里的K值是设置为24吗?但是设置为24之后跑出来只有一个sample.clean.counts_GATC.24g1.txt,显示所有contig都划分到这个组里了,为什么呢?该如何解决?attachments-2025-04-TkIci24y680838a83c142.png

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最佳答案 1天前

k=24的设置是没有问题的,如果你的contig比较少不太碎,他自动的信号识别可能会出错,这个时候考虑在juicebox手动划分吧

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