10 视频课程已经学完，有一个问题，视频中演示的搜索拟南芥的NB-ARC基因家族，这里的拟南芥指的是拟南芥属吗，是有很多不同种的拟南芥组成的吗？
视频课程已经学完，有一个问题，视频中演示的搜索拟南芥的NB-ARC基因家族，这里的拟南芥属的蛋白质序列，是有很多不同种的拟南芥的吗？
我自己在实际操作的过程中是不是需要把我研究的物种的属下面所有的不同的种的蛋白质序列下载下来搜索呢？
因为我ensembl数据库下载了一个细菌的基因组，hmmsearch搜索保守蛋白质结构域，只出现了一列蛋白保守结构域对应的id及后面的信息
那我要研究该基因家族的话，是不是要把这个细菌的所有属的蛋白质序列全部都下载下来呢？
如果要下载的话，是不是要一个一个的下载呢，有没有方法可以一次性下载所有属的菌的蛋白质序列呢？
最佳答案 2019-01-08 10:39
好好理解一下物种分类：门纲目科属种， 拟南芥的基因组是一个种，不是属，没有混合；
你的一个属里面的不同种的细菌，需要一个一个单独的分析，不能批量混合；
还有，细菌不像高等植物，一个家族的基因有很多个，细菌基因组小，一个基因家族的基因可能只有一个；
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