想请教下，就是我测了种子五个不同发育时期的转录组，想通过转录组数据中的表达量筛选出几个候选内参基因，用什么条件筛选呢？

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我是通过所有基因FPKM值得文件进行筛选的，目前知道的是①CV小于0.15，②两个时期比对log2（fold change）绝对值小于0.2，筛选出了四百多个基因，还有什么条件可以筛选呢？比如FPKM值介于多少比较好？

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2019-01-14 09:24

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

内参基因都是通用的，稳定表达的基因就可以，可以参考：https://www.omicsclass.com/article/110