我之前下载PRAD前列腺癌数据的时候,运行图二代码最后能够在文件夹里头找到RDA文件和TXT文件,但这次下载HNSC的时候,运行相同的代码只能在文件夹里头找到RDA文件而没有TXT文件
这txt 文件是在后面保存结果才产生的,不是下载数据的时候产生的。 你看看文件的名称,是不是下面这行代码产生这个文件的:
expr_file <- paste0(DataDirectory, "_","All_HTSeq_Counts",".txt") write.table(data_expr, file = expr_file, sep="\t", row.names =T, quote = F)