isoseq3分析lima去除测序引物问题

大家好，

我用lima去除pacbio的barcode的过程中出现这样的问题：

barcode序列是这样的：

5’ – pATCTCTCTCTTTTCCTCCTCCTCCGTTGTTGTTGTTGAGAGAGAT – 3’

lima ../m54220_181204_080956.subreads.ccs.bam primers.fasta test.demux.ccs.bam --isoseq --no-pbi

有谁能给我个建议问题在哪里吗？

谢谢！

静静

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1 个回答

microRNA 2019-01-21 16:30

接头序列不对，或接头序列文件格式不对。