也许是method和数据有冲突，可以尝试其他的校正method，基于你显示的数据，测试了几个其他的method可用，你可以多调用其他的：
10 请问为大神，这种情况该怎么处理？
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具体代码如下
：
workdir="C:/Users/dong/Desktop/2/GSE40807_RAW"
setwd(workdir)
dir.create("result")
files = list.files(workdir, pattern = "GSM")
files
RawData=read.maimages(files=files,source="agilent.median",green.only = T)
show(RawData)
EListRaw=RawData
dim(EListRaw)
colnames(EListRaw)
BgCorrect=backgroundCorrect(EListRaw,method = "normexp",normexp.method = "rma",offset = 50)
BGandNormalized=normalizeBetweenArrays(BgCorrect,method = "quantile")