最近想做些DNA甲基化的实验,就找之前做重测序的公司询价,但是报价高了好多,每G数据量价格差不多翻倍了,他们的销售也说不出所以然,请问这个情况正常吗?
你好,DNA甲基化测序和重测序虽然都是拿DNA进行实验的,但是其实验过程还是有不小区别的。
在建库方面,做甲基化时需要先对DNA进行重亚硫酸盐处理将未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基变成尿嘧啶,建库成本比重测序要高;在测序的时候,由于甲基化属于非均匀文库,有效数据产出量低,如果想测10G,一般来说测序公司得按20G乃至更多去做,才能得到足量的有效数据。
总的来说,甲基化建库和重测序建库的区别还是不小的,成本也不一样,所以价格不一致也是很正常的。