绘制转录本结构图通过gffread提取gtf文件transcript_id后名字错误，请老师指教 - 组学大讲堂问答社区

绘制转录本结构图通过gffread提取gtf文件transcript_id后名字错误，请老师指教

程序正常运行

这是最后的结果

GFF源文件

请老师指教，谢谢！

0 条评论
分类：基因家族分析

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2 个回答

omicsgene - 生物信息 2019-02-24 09:24

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

程序没有出错，读取的是以下ID，你截图的部分gffread不会读取：

尽量不要在NCBI上下载基因组注释信息，后期不好处理；

安生水 2019-02-24 18:39

擅长：perl,基因家族,linux,chip-seq

ncbi数据库基因组基因ID与我们熟悉的不太一样，建议别用。

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clcprince 提出于 2019-02-23 15:27