如果没有过滤 输出的node文本应该是完整的,不过,cytoscape用的应该是edge文本,这个往往会阈值过滤,具体的还是和代码相关
在进行WGCNA分析时,全部分析完之后。
table(moduleColors)
显示模块里面的数目
我的兴趣模块有600来个基因数
之后我在cytoscape那个文本里面,node文本里面,我发现只有400来个。
之后检查了下,cytoscape里面的node数目全都少于table出来的数目。
我不知道哪里出问题,我看也没有数据剔除。请老师回答下。