有关基因家族鉴定学习课程的问题：在利用hmmer软件鉴定基因家族成员的过程中，domain脚本运用时需要输入的域值是一定的吗？不是的话是怎么设定呢？（讲解的课程上是1e-20）那之后的将最终生成的txt文件数据复制在表格中进行筛选的域值 （拟南芥筛选的是0.01）跟之前的设定域值有关系吗？

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

不知道你说的是哪一步操作，可贴图说明；

关于阈值的选取，可以参考文献解读：基因家族文献思路解读

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安生水
擅长：perl,基因家族,linux,chip-seq

这个不是固定的，看你要分析的基因家族的实际情况而定。

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