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请问,TCGA数据库中下载的数据如何区分癌组织和癌旁呢?
TCGA
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TCGA
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omicsgene
- 生物信息
2019-03-03 17:59
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
可根据样品编号区分不同的类型,具体见:
https://www.omicsclass.com/article/439
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Anne
提出于 2019-02-28 14:13
相似问题
请教一下TCGA的蛋白数据怎么理解,它是有正负值的,这个正负值代表什么意思,为什么蛋白表达会有负值?我只想给它分成高表达,低表达和表达缺失组应该怎么处理呀?
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老师,想请教一下TCGA基因表达数据的问题,我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv;然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ,没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换,却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID,想问下老师,这种情况该怎么处理?同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个?
1 回答
TCGA的RNA-seq count annotation过滤,有些不知道是否需要删除
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