我看网上大部分小伙伴用cd-hit 都没有用到-t这个参数 查看了他的帮助文档 意思是:tolerance for redundance, default 2. 没理解这是什么意思,请前辈们有空解一下惑,谢谢!
cd-hit 默认 -t 这个参数值是2. 就是,你不设置,它就是2了。