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351
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在用gemma进行亲缘关系矩阵计算时,已经給fam文件添加表型但还是报错
GEMMA
林烨奇怪怪。
2024-09-29 15:21
0
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338
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为什么vcf文件根据不同参数过滤后保留163138个位点但最终LM和LMM进行关联时却只有102296个snp位点?
林烨奇怪怪。
2024-08-20 17:50
0
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425
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老师我已经用gemma找到了显著位点,现在想将两位点之间连锁不平衡程度r方大于0.35,且标记之间距离在300KB以内整合成一个qtl,应该用什么命令啊?
WHR
2024-08-15 12:30
0
回答
479
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感兴趣的区域LD热图不包括indel位点?
区域LD热图
LD衰减距离
Changing
2024-07-27 10:29
0
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578
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单倍型分析报错
单倍型分析
Changing
2024-07-22 17:12
0
回答
733
浏览
使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448
mike
2024-03-18 16:27
0
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748
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https://snp-seek.irri.org/_download.zul从这个网站下载全基因组测序文件,进行GWAS分析,下载哪几个啊
周游
2024-01-26 22:26
0
回答
818
浏览
https://snp-seek.irri.org/_download.zul从这个网站下载全基因组测序文件,进行GWAS分析,下载哪几个啊
周游
2024-01-26 22:24
0
回答
791
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填充的时候出现位点错误
基因型填充
231
2023-12-15 21:51
0
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868
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添加性别和年纪为GWAS影响因素
效应
231
2023-12-11 19:47
0
回答
950
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gemma分析时,有的样本表型数据缺失怎么办?
2023-12-06 19:39
0
回答
915
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可以利用重测序的结果做表型预测模型吗?(模型构建数据仅基于重测序结果做)
周游
2023-11-21 16:56
0
回答
1148
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Tassel做GWAS分析时混合线性模型报错,文件格式如下,内存足够,但是还是报错。
马杰宇
2023-09-21 21:39
0
回答
945
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请问GCTA运行报错,打不开软件怎么回事呢?
基因型
LU
2023-09-21 19:23
0
回答
1005
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先进行基因型填充还是先SNP过滤
231
2023-09-11 11:13
0
回答
1594
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admixture绘制群体结构图
群体结构
林长春
2023-04-14 20:41
0
回答
1535
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报错出现“Non-unique name 'IRIS_313-7' in the alignment”
报错
YL珑
2022-11-25 09:18
0
回答
1192
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怎么将tped格式里面的chrA01 chrA02 chrA03...转换成数字1 2 3....
黄益丹
2022-11-09 11:43
0
回答
1715
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LDdecay
LD decay
Wang J
2022-11-04 16:14
0
回答
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tassel 计算PCA
PCA
林长春
2022-11-01 17:29
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