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老师您好,单倍型分析的图是这样的,我关注的是蓝色框起来的标记,这个snp处于一个高度连锁的区域吗,属于左边的block还是右边的block呢
单倍型分析
Faith_
2024-12-09 08:33
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老师您好,单倍型分析的图是这样的,我关注的是蓝色框起来的标记,这个snp是否处于一个高度连锁的区域,属于左边的block还是右边的block呢
2024-12-08 23:43
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GWAS分析
shidandan
2024-11-21 21:37
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在filezilla里,将硬盘里的数据拖进自己建立的文件夹是总是传输不成功,是什么qingkuang
不如
2024-10-27 20:16
2
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576
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在用gemma进行亲缘关系矩阵计算时,已经給fam文件添加表型但还是报错
GEMMA
林烨奇怪怪。
2024-09-29 15:21
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gwas脚本中的tassel计算变异位点p值的命令中,结果会自动过滤掉indel,如何保留indel,并计算其p值?
indel变异的p值计算
2024-09-03 17:57
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553
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gwas根据阈值筛选关联的SNP,并生成bed文件,排序时无法生成标准的bed文件
per
2024-08-22 15:07
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为什么vcf文件根据不同参数过滤后保留163138个位点但最终LM和LMM进行关联时却只有102296个snp位点?
林烨奇怪怪。
2024-08-20 17:50
0
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559
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老师我已经用gemma找到了显著位点,现在想将两位点之间连锁不平衡程度r方大于0.35,且标记之间距离在300KB以内整合成一个qtl,应该用什么命令啊?
WHR
2024-08-15 12:30
2
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709
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3
GWAS计算表型数据blup时一直出错
BLUP
Liquor
2024-08-08 11:46
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588
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老师您好,为什么在gwas最后的筛选关联区域SNP信息时,总报错错误信息如下,总是被杀掉,vcf文件应该是没有错的,截图如下,输入文件如下,请您帮忙查看,我该怎么修改我的命令
WHR
2024-08-04 18:46
1
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681
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怎么过滤vcf文件中INFO列中的DP参数?
SNP
vcftools
李念
2024-08-01 18:25
2
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tajimaD pi绘图
Tajima
Wang J
2024-07-30 15:48
1
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620
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关于基因受选择计算
Tajima
Wang J
2024-07-29 18:42
0
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646
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感兴趣的区域LD热图不包括indel位点?
区域LD热图
LD衰减距离
Changing
2024-07-27 10:29
0
回答
736
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单倍型分析报错
单倍型分析
Changing
2024-07-22 17:12
2
回答
727
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在做GWAS关联分析,利用gapit软件发现不同模型产生的hd.$m.GWAS.Results.txt一模一样
GAPIT
Changing
2024-07-19 16:52
1
回答
787
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gwas
Jay
2024-06-28 14:50
1
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691
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在用gemma分析gwas时,调用perl脚本中的sort_trait.pl,发生报错,请老师帮忙解答,谢谢老师。
GEMMA
东篱
2024-06-17 11:13
1
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818
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3
利用代码进行曼哈顿图制作中报这种错误,应该如何解决?
东篱
2024-05-31 21:15
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