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老师您好，做完蛋白序列多序列比对后，分析基因家族的保守位点，怎么判断那段保守位点指的哪个氨基酸活性位点呢，然后画出像文献中这样的图

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老师，基因组网站没有泛基因列表，自己怎么整理出来这个列表文件呢

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10 使用NCBI下载的基因组和gff文件进行基因家族分析时，保留编码蛋白基因的命令似乎无法识别NCBI的gff文件（描述中为日志，图片为尝试获取的gff文件）

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老师，我在用GSDS绘制顺势原件作用图的时候，只显示一部分基因的顺式作用元件，另一部分只有CDS。我试过单独贴每一个基因，是可以的。这种情况该怎么办？（ID检查过了，也更换浏览器，都不行）

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老师，为什么我的cds和pep文件导不出来呀？导出来报错，并且文件内容无。最后一张照片时我退出重进后的历史命令

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进化树想修改一下分支

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老师能把你整个过程执行过的代码发一下吗，一直对着视频找有差别的地方，纠错很麻烦

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老师，您好，我做基因家族分析时绘制表达模式热图，因为我的GFF3文件是从ensemble上下载的，发现从NCBI上下载的转录组数据的基因ID与我的基因ID不一致，这时该怎么判断那个是同一个基因呢？

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老师你好 我在进行保留最长转录本的时候报错

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误删文件导致docker启动不了了

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结构变异注释结果文件为空

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MCScanX这一步做完分析后发现了问题

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使用ensembl下载的人gff3文件进行基因家族分析时，保留编码蛋白基因的命令无法识别人的gff3文件（描述中为日志）

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在基因家族分析时，保留编码蛋白基因命令时出现 “bash: agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl: command not found”

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镜像安装，镜像安装

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泛基因家族分析，提取CDS序列结果如图所示，并且文件大小只有38KB，是不是这个基因组就不能用了

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20 您好我用OrthoVenn和拟南芥做同源比对，结果我应该下载哪一个去做string网站上的比对，构建ppi

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老师，下面是报错、染色体信息、gff文件中的染色体和命令行

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使用promo网站分析动物顺式作用元件遇到问题

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老师，为什么我找的家族在本物种里的结构域会这么少呢？换了个物种也是一样的情况，甚至更少了，一个原因是事实情况就是如此，只能换家族，另一个会不会是我操作有问题呢？第二张图是我的历史代码，麻烦老师帮忙看看