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请问用相同的文件，只是把名字改了一下，然后docker自动把重复的序列删除后，为什么出来的motif不一样啊

  • 李 2024-01-05 15:36
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请问老师，对基因组数据进行处理，保留最长转录本为何会出现一个基因有两个5端UTR？如截图所示。

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hummersearch命令出错-2

  • nuli 2024-01-05 11:57
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不同物种间的同源基因对Ka/Ks计算需要用哪些文件呢

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老师您好，做完蛋白序列多序列比对后，分析基因家族的保守位点，怎么判断那段保守位点指的哪个氨基酸活性位点呢，然后画出像文献中这样的图

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docker发生错误

  • nuli 2024-01-09 22:30
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基因家族鉴定

  • 2023-12-28 13:03
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老师，为什么seqtk在桌面版docker就能运行，换到服务器就不能运行了

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老师，基因组网站没有泛基因列表，自己怎么整理出来这个列表文件呢

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10 使用NCBI下载的基因组和gff文件进行基因家族分析时，保留编码蛋白基因的命令似乎无法识别NCBI的gff文件（描述中为日志，图片为尝试获取的gff文件）

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circos绘图出现错误，有svg但是内容不对，没有出现png格式的图

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老师，我在用GSDS绘制顺势原件作用图的时候，只显示一部分基因的顺式作用元件，另一部分只有CDS。我试过单独贴每一个基因，是可以的。这种情况该怎么办？（ID检查过了，也更换浏览器，都不行）

1 解决

做基因家族分析时筛选出的基因氨基酸数量少

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蛋白3D结构预测时出现非法字符

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基因家族分析-基因家族成员鉴定

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是没有gene-family了嘛

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一个家族基因隐马尔科夫模型

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5 蛋白三级结构分析时，用PSI-blast和SWISS-MODEL自带的模板同时做了，发现SWISS-MODEL自带的模板做出来的相似度更高、GMQE和QMEAN值也更好，同时，两个方法也有重复的模板，想问问老师应该选择相似度更高的，还是选择两种方法都有的模板？

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docker 运行报错

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软连接报错，基因组文件可以软连接成功，gff文件报错