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老师,在泛基因列表构建时,总共113个基因组,成功提取了最长转录本,提取bed文件,但提取cds文件时,有一个文件A10总是失败,不知道什么原因。
泛基因家族提取cds和pep
Connie
2025-02-26 15:25
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老师,我正在做泛基因家族分析,在构建泛基因列表时,整理完matrix.txt文件,进一步进行矩阵整理时,得到的pangene.txt为什么都是nogene呢,另外,我们老师,我正在做泛基因家族分析,在构建泛基因列表时,整理完matrix.txt文件,进一步进行矩阵整理时,得到的pangene.txt为什么都是nogene呢,另外,我们
泛基因家族分析
Connie
2025-03-07 10:55
0
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226
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老师,在泛基因列表构建时,总共113个基因组,成功提取了最长转录本,提取bed文件,但提取cds文件时,有一个文件A10总是失败,不知道什么原因。
Connie
2025-02-22 21:11
1
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老师,我在构建泛基因列表时,做cat pangene_filter.*lifted.anchors | grep -v "^#" | awk '{print $1"\t"$2}'> ../03.jcvi-pan-vs-genome/syn.txt这一步,找不到pangene_filter.*lifted.anchors 是怎么回事
泛基因家族分析
Connie
2025-03-04 09:05
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2025-03-11 11:34
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老师我在构建泛基因列表,合成last.txt文件,结果只有两列
泛基因家族分析
Connie
2025-03-06 21:29
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2025-03-07 15:11
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有两个基因不在染色体上在contig上,为什么会这样,图片里的contig可以删掉吗,会有什么影响吗
轻绘梨花泪沾衣
2025-03-23 14:57
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core dumped
落日与晚风
4天前
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老师您好,我正在做泛基因家族分析中,家族成员存在缺失分析,需要准备泛基因组列表,前面通过学习咱们得泛基因集构建课程,生成了 final.last.gene.pair.txt 文件,整理格式之后不正确
Connie
3天前
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