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5 基因家族分析绘制基因在染色体上的位置gene_chr.txt是空文件

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10 求助大佬，circos图chr.info文件怎么整理？

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5 老师您好，我在用MEGA构建完系统进化树后，树的下方有一大片空白，选中某一分支的绿色选中框也偏下，不在分支本身，卸载了又重装，重新分析建树依旧是这种情况，想请教一下老师有没有遇到过这种情况，谢谢！

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20 想通过文献来确定拟南芥UFGT基因家族有多少个成员，但是苦于一直没结果，老师能帮忙推荐一下有什么文献吗

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5 求助大佬，MCScanX输出结果空白

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5 求助大佬，通过id提取domain序列的时候，e_value设置1e-20一个都没有怎么办？

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5 老师您好，在用mcscan分析之前发现，gff文件里没有gene，只有cds和exon怎么处理？

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5 clustalw我输入1,回车,结果1被删除,程序不运行,试了无数次都是这样,哪位知道这是为什么呀?谢谢了!检查序列没有重复

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10 老师您好，做基因家族分析有几个问题不明白想问问您：（1）实在找不到组装到染色体的基因组，可以用scaffold水平的画基因重复性图吗？会不会影响发文章 （2）能不能分析两个比较有相关性的基因家族或者结合转录组分析，增加一点文章接受几率？（3）用hmmsearch筛选蛋白，构建新模型，再筛选，筛出来200多个蛋白，但是alignment之后发现保守结构域差别很大，gap特别多，是出了什么问题吗？

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5 请教老师mcscanX作图问题

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5 老师您好，我想请问一下，通过分析找到的基因家族成员在NCBI上都是预测基因，继续分析没有问题吗

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10 老师我想问一下用circos绘制基因组内共线性图时，config2.txt文件中的目标基因link.txt部分怎么更改才能使目标基因在图上的字体放大并且设置斜体？如下图：

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5 mcscan_layout参数都是有关什么呢？求教

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10 在运用Linux系统命令，KA/KS，计算重复串联基因时，出现的duplication_gene文件，有点问题

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5 想要用evolview美化进化树，可是newiek格式的进化树一直传不上去，这是为什么？哪位老师知道，求助！

  • 2020-02-07 17:14
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20 请教用gtf文件获取基因与mRNA的对应关系的问题

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5 基因家族分析时，顺式作用元件提取只能提取列表中的一部分基因，请问是什么原因

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5 进化树boostrap值过滤

  • 2019-12-24 16:53
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5 染色体位置，导出之后是空文件

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3 MCSCANX共线性分析原理和串联重复分析