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20 我使用OrthoMCL处理blast产生的结orthomclBlastParser blastresult compliantFasta > similarSequences.txt，出现了问题，不知道怎么解决

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5 鉴定同源基因的orthoMCL和OrthoFinder在结果上有什么区别嘛？谢谢各位老师啦~

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你好，家族分析时要求把序列和进化树上传到tree base数据库中，有上传过的吗？

  • we 2021-07-26 16:21
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无法下载MCScanX-transposed

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老师，我在做共线性的时候遇到下面的问题，该如何解决

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去冗余的同时，提取前两列的信息

  • lkl 2021-05-13 16:05
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请问下面这个蛋白质三级结构的 紫色的球状代表什么结构？？我研究的是家族 好多蛋白都没有这个结构

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老师，你好，我看基因家族分析那个课，找不到TBtools的安装包啊。网上找的没有您课件展示的提取motif分析结果的那个功能，麻烦您能再分享下您的TBtools的安装包吗？

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基因家族共线性分析的时候，水稻基因组按照脚本来还是查找不到想到了的 ，提取不出想要的序列

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求教PlantCARE网站 打不开，有别的网址吗

  • 2021-02-18 23:54
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各位老师好，我想问一下为什么这两个步骤结果对不上，第一个结果里面没有cds的信息。而第二个都是cds的序列。基因文件是在ncbi上下的

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5 求蛋白家族的进化聚类分析详细方案

  • 2021-02-01 00:03
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在基因家族分析的时候，结构域的筛选E-value值的时候，选取小于0.0001，运行命令，结果中并没有排除掉一些大于该值的序列，3.4e-05到底等于多少，是3.4乘以e的-5次方还是3.4e的10的-5次方

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共线性分析得出的基因对可以用于kaks分析吗？还是只有串联重复的基因对才可以用于kaks分析啊？

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提取结构域序列

  • 荣 2020-11-28 15:33
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请问我用Evolview美化进化树时，为什么图片输出的不完整，有四百多条序列？

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请问大家在构建进化树的时候，发现分组与拟南芥中的不同，比如A4分组被分开了，请问有什么解决方法吗？谢谢

  • 2020-11-15 20:10
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动物基因顺势作用元件的预测

  • 2020-11-11 16:47
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问一下老师们，在用get_genefamily_bed.pl 这个脚本，提取自己基因家族位置信息的结果文件总是为空，下面是为的输入文件。perl get_genefamily_bed.pl -in1 SAT.IDlist.txt -in2 Oryza_sativa.IRGSP-1.0.47.gff3 -out MtN3_SAT.bed执行的是条命令。

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5 单个物种的单个基因的kaks怎么计算