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10 NCBI基因组格式修改的时候报错，蛋白质文件无法解析

  • eknd 2023-09-05 09:02
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计算直系同源基因的KAKS时，发现KS>1，是不是哪里算错了？用KAKS-Calculate2.0算的，为什么KS大于1呢，然后黄老师给的关于介绍KSKS的文章链接上面并没有解决这个问题

  • 2023-09-03 00:29
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老师好，在提取顺式作用元件的promoter.fa这一步中，只能提取部分基因的元件，应该如何解决呢？

  • siu 2023-09-02 20:58
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老师，我分析的物种是小众物种，没有蛋白和cds序列，进行提取cds和pep时出现了下面的报错，是必须符合ensemble格式才能使用吗？

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genedoc 多序列比对导出RTF格式文件，序列对不齐，应该怎么解决呢 图片不清晰

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请问这里我有什么错误吗，怎么出来的不一样

  • 李 2023-08-22 12:16
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mRNAid_to_geneid.pl这个文件是所有基因共用的，还是不同基因这个文件也不同

  • 李 2023-08-22 10:57
1 解决

PUTTY中kaks计算显示Checking Epal2nal.pl: [NA]

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3 纯生信的基因家族文章，比较推荐投什么期刊?

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pymol怎么保存结果照片为PDF格式？这里面只有PNG，也没有dpi的修改。然后保存的时候怎么去掉未注册等的字样

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基因注释文件gff第9列，ID标签和parent标签与蛋白序列和cds序列里面的ID都不一致怎么办

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热图绘制需要做几次转换

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请问进行基因家族鉴定分析需要准备哪些文件

  • 2023-08-14 10:48
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5 基因家族分析的文章被人提问为什么最长的基因对应的不是最大的蛋白

  • 2023-08-14 08:30
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motif筛选的条件

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基因家族表达量热图的时候没有找到合适的FPKM文件

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NCBI上下载的CDS序列的ID和GFF文件的ID对不上，导致CDS提取失败怎么办

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5 基因家族MCScanX共线性分析中是否把串联复制和大片段复制都筛出来了？

  • 2023-07-29 15:06
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基因家族分析的蛋白结构预测，怎么比较预测的不同亚类蛋白3D结构的相似性？

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MapChart做完图之后保存不了怎么办