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两个结构域的hmm搜索

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老师您好，做基因家族鉴定分析时如何将网站上筛选的基因家族与自己的转录组鉴定得到的基因家族融合在一起？

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HMM搜素后显示No targets detected that satisfy reporting thresholds，生成的文件没有候选基因

  • 2022-07-05 20:44
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启动子feature.bed

  • 荣 2022-06-28 21:58
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circos作图输入文件

  • 荣 2022-06-23 14:27
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3 老师您好，我最近做基因家族分析，基因加倍与串联重复分析MCScanX出现了这样的报错。没有找到相似的错误原因。

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就是对鉴定到的基因家族进行命名

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老师，我在进行重复基因计算Ka/Ks的时候，一共找到6对串联重复基因，但是其中有3对算不出Ka/Ks，这是为什么？

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求助：Docker启动不了了。

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10 【MCScanX】 tandem文件中【串联重复】基因对，若其中一个基因A属于已鉴定基因家族，另一个基因B由于结构域不完全被剔除在外。请问在circos绘制串联重复图时，还要保留A基因吗？

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老师，我在做基因结构分析的时候，有的基因上没有这10个保守结构域中的任何一个，这是为什么啊？是我哪里做错了吗？

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您好!我目前在学习基因家族课程，想要对鉴定到的基因家族进行细分，重命名等

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求助!我在学习老师的基因家族分析时，使用代码进行复制文件时总是报错找不到文件！！！！！

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求助!我在学习老师的基因家族分析时，使用代码进行复制文件时总是报错找不到文件！！！！！

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10 老师好，我的物种没有基因组，只有转录组可以做基因家族分析吗？

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老师，我用MEGA构建进化树的时候找不到我的FA文件

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MCSCan共线性绘图报错，找不到错误原因。bed中所有染色体已经自查全部对应，去除了英文编号染色体

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docker使用时没法连接虚拟机和自己的电脑硬盘

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老师，您好，我想问下这种格式的基因注释文件，要怎么做？我下载的都是基因组的gff3格式的注释文件，没有办法去除多余的转录本

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请问一下，这种格式的注释文件，要怎么做？我下载的都是基因组的gff3格式的注释文件