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5 对基因家族比对结果验证，不同数据库的反馈差异很多，求解惑

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询问《基因家族分析（生物信息）》资料下载地址

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我现在遇到的问题就是在基因家族中去除多余的转录本的时候提取不到对应的基因号

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docker虚拟机进不去咋办

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请问虚拟机进不去咋办

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基因家族分析-家族成员鉴定-下，gff3中mrna的ID号比pep中的多一个后缀怎么删除？

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circos作图上染色体颜色的设置

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老师您好，我做藻的基因家族分析，构建进化树的过程中遇到了mega软件比对NJ法不能够完全比对成功，显示总是有一次错误，进化树显示不完全，更换其他方法后，进化树也都显示不完全，请问这样的有什么解决办法嘛

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MEME分析中，motif的E-value值太高，意味着不准确了。对吧。

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老师，在进行基因上游顺势原件分析的时候，得到的图是下面这个样子，怎么办啊？

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老师，我在进行基因上游顺势作用原件分析的时候，在得到feature文件的时候是根据第一张图片的命令改的，改的命令在第二张图，但是我没有得到feature文件，这是为什么啊？

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老师您好，基因家族分析时，用拟南芥某基因家族用blast比对目标物种蛋白质序列，最后得到的结果有503条，这503条应该怎样取舍，然后做下一步结构域搜寻？谢谢

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老师，我做进化树+基因结构+motif一张图全显示的时候是这个样子，为什么有很多基因没有基因结构？但是我在GSDS上得到的基因结构图是长这个样子的，这是为什么啊？

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老师，我在进行基因结构展示时，GSDS error报错，是下面这个图片的样子，这是为什么呢？是哪一步出错了？

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老师，我基因组间共线性报错，能帮我看一下吗？ls之后有mcscan_layout

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通过blast比对来确定基因家族

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老师，输入这个代码echo "1\nT-box_domain.fa\n2\n1\ndomain.aln\ndomain.dnd\nX\n\n\nX\n" |clustalw之后，会循环下面的页面，无法输入选择和输入文件

  • 2022-04-21 15:41
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3 使用evolview美化进化树时，执行部分填充命令，却会填充所有线条颜色

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virtual box共享文件失败

  • Zik- 2022-04-18 12:51
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老师您好，多序列比对完后构建进化树遇到了错误，建不了树，但是删掉几个序列较短的基因又能建树，这种情况怎么办，如果在筛出一些基因要怎么筛除