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请问针对基因家族的分析 ，预测motif使用domain.fasta序列还是全长序列比较好？

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老师您好！用meme分析motif时，输入/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme ../WRKY_pep_confirmed.fa -protein -oc ./ -nostatus -time 18000 -maxsize 6000000 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 -maxw 100命令后显示zsh：no such file ordi

  • 2021-03-28 18:54
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无全基因组物种基因家族鉴定，利用转录组及全长数据，发现看到别人发表同物种自己正在做的基因，但胁迫处理不同，我可以继续做吗？还是换题

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如果提取基因一条代表CDS序列不成功，mRNA与CDS，GENE的ID都不一致（马铃薯数据库）

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您好，我想问问您在blast搜索鉴定之后如何提取对应的domain呢

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20 想问问老师和大家，blast搜索鉴定之后如何提取对应的domain呢

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老师您好！用meme分析motif时显示zsh：no such file or directory:/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme。该怎么解决这个问题呢？谢谢

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hmmsearch出现Error: Failed to open sequence file aa.fasta>uu.out for reading，如何解决呢？？

  • kKUI 2021-03-10 19:18
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请问Divergence-Time是 T = K s /2 r 计算吗？

  • 大k 2021-03-09 21:02
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老师我想咨询一下，之前做基因结构分析的软件GSDS打不开，一直提醒网页错误可能是什么原因您

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MCScanX 圈图都是灰色

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老师，在MCScanX共线性分析中，我用学校的服务器，请问用python的mcscan如何进行这一步的分析啊。

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老师您好我做进化树的时候每次都报错，想请教您一下

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circosb报错

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老师您好，我在使用mRNA_to_geneid.pl脚本提取自己样本基因组gff文件时报错了，请问我要怎么修改这个脚本才能解决问题呀？

  • lkl 2021-03-04 15:18
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kaks转换报错

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请问一下老师 学长让我在五条序列里挑一条结构域完整的 我不清楚怎么操作判断 可以指点一下嘛

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制作启动子顺式元件时，为什么报错呢Error:35

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老师请问这个没有共线性结果是哪里出问题了

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各位老师好，我在做mcscan共线性分析的时候，在绘制图片的最后一步，出现了一个报错