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3 结构域建树

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请问这两个基因ID不同是有什么区别吗？在后面做筛选的时候，就只能出来基因ID短的，这些基因ID长的筛不出来的原因是什么呢？希望可以回复下

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老师，麻烦问一下制作基因结构图时，gene_exon_info.gff文件始终为空的，

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想请问一下老师，出现这个怎么解决？

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老师好，有关blastall参数的问题！

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请问老师，如果想做某个基因家族在不同物种之间的进化树怎么做，基因数量太多，无法构建基因的进化，应该如何构建物种进化呢？？

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老师你好，我用HMM鉴定马铃薯PPR家族成员时出现了问题，如下图，请问是什么原因导致的

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20 老师，请问做基因上游顺式元件分析时，只有cds文件，gff文件和pep文件，该怎么提取promoter序列

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手动分析跟MCSanx分析出来串联重复基因一样吗

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20 老师，请问做基因上游顺式元件分析时，只有cds文件，gff文件和pep文件，该如何提取promoter序列

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10 老师，请问只有gff文件，cds文件和pep文件，该如何做基因上游顺式元件分析

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在GSDS获得基因结构图时，我的gff文件里有40条，结果图上只有五条，是怎么回事呢？

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老师，请问一下，用TBtools打开meme.xml文件出现报错，这种情况是怎么回事呢？

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GSDS error 报错

  • Iron 2020-04-17 08:16
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老师，您好，最近做的bHLH转录因子的文章，我做序列比对的时候需要先知道它有几个亚家族吗是要从亚家族里边找出来几个氨基酸序列进行比对，怎么确认水稻和拟南芥属于这个亚家族，还是把物种的所有序列都比对，比如，拟南芥有二百多条，水稻有一百多条等，谢谢您

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怎么在hmmsearch的XXX.out结果里，截取基因ID，L最后再提取序列？Linux系统下怎么编码

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关于KA/KS的计算和种内圈图

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10 老师你好，最近我在使用tbtool的blast时发生报错

  • LGC 2020-04-15 03:10
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关于KAKS的方法选择以及密码子选择

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10 请问老师有没有get_gene_position.pl，get_gene_bed.pl，get_fa_by_id_from_bed.pl这个三个脚本的下载地址？