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591
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泛基因家族分析,提取CDS序列结果如图所示,并且文件大小只有38KB,是不是这个基因组就不能用了
GFF
GFF3
Orange_flame
2024-06-20 11:39
0
回答
741
浏览
已知一个基因家族有多个亚家族,在做进化树时,如何在进化树中将各个亚族区分开?
进化树
petrichor
2024-06-14 12:33
2
回答
593
浏览
误删文件导致docker启动不了了
泛基因组家族
docker
xphao
2024-06-11 21:31
1
回答
725
浏览
老师好,我想问下为啥用mega软件做出来的的进化树为什么左边的线条这么拥挤呀?第二张是我做的,第一张是视频老师教的
MEGA
蚩尤
2024-06-07 15:15
1
回答
517
浏览
老师好,这个grep -f的命令我在帮助中没看到,想问下这行代码的意思是啥,主要是grey -f我看不明白
grep
蚩尤
2024-06-07 15:12
1
回答
605
浏览
物种间共线性分析报错
python版mcscan
Orange_flame
2024-06-04 20:14
1
回答
550
浏览
老师,您好,我做基因家族分析时绘制表达模式热图,因为我的GFF3文件是从ensemble上下载的,发现从NCBI上下载的转录组数据的基因ID与我的基因ID不一致,这时该怎么判断那个是同一个基因呢?
满城
2024-06-03 19:30
1
解决
498
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老师好,右边group1里面的两个wrky结构域,在左边这个图里咋体现出来的呀?我只看出了第一个,就是第一个框框出来的
基因家族概念问题
蚩尤
2024-06-02 20:42
1
回答
566
浏览
我使用hmmsearch时弄出来的文件是空文件夹这是为什么嘛? 我下载的是hmmer3.0 windonws版
hmmersearch
坐在蘤院看日落
2024-05-30 12:33
2
回答
650
浏览
docker 运行报错
docker
xphao
2024-05-27 23:49
1
回答
527
浏览
老师您好,亚细胞定位预测出来的结果很多,需要都写上吗
亚细胞定位
满城
2024-05-27 20:14
1
回答
728
浏览
老师您好,做完蛋白序列多序列比对后,分析基因家族的保守位点,怎么判断那段保守位点指的哪个氨基酸活性位点呢,然后画出像文献中这样的图
domain
geneDoc
满城
2024-05-27 18:01
0
回答
680
浏览
基因家族分析-基因家族成员鉴定
基因家族成员鉴定
一枚安静的咸鸭蛋~
2024-05-24 20:47
1
回答
618
浏览
基因家族分析--结构域在线数据库中确认
pfam
CDD
hmmersearch
一枚安静的咸鸭蛋~
2024-05-23 15:51
2
回答
701
浏览
老师,基因组网站没有泛基因列表,自己怎么整理出来这个列表文件呢
Orange_flame
2024-05-20 09:24
1
回答
904
浏览
5
老师你好,我在用w.sh里面的第二次搜索结构域命令的时候出现报错(下图),请问如何解决
基因家族
BIO
2024-05-17 16:55
1
回答
591
浏览
老师你好 我在进行保留最长转录本的时候报错
AGAT
林ioo
2024-05-16 16:26
1
回答
552
浏览
老师,提取出来的结构域是下图那样,这条命令应该怎么改:#选择第一个结构域进行后续分析 sed -i "s/_.*$/_${ind}/g" ${ind}.UGT_domain1_final.fa
泛基因组家族
Orange_flame
2024-05-14 17:00
1
回答
623
浏览
隐马尔可夫模型hmm文件下载不了了
HMM
hmmer
谭小云
2024-05-10 10:33
2
回答
567
浏览
老师,我的基因命名格式是图片这样的,这条命令应该能怎么改呢,
Orange_flame
2024-05-08 15:09
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