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5 提取不出来结构域序列

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5 你好，我想将GFF 文件里面ID中一些不必要的信息删除，请问应该怎么写命令呢？这个物种gff文件比拟南芥的gff文件要复杂的多

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5 基因家族分析预测顺势原件时，得到的Ptomoter文件中原来43个基因只有29个显示启动子序列，其余19个无序列信息

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hmm文件搜索问题

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如何将提取domain的脚本修改为提取所有domain？

1 解决

10 在使用bio-linux中的meme分析蛋白保守结构域的时候出现问题。

  • dec. 2019-07-10 10:43
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我的hmmsearch结果第一列（target neme）不是geneid 也不是转录本id

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利用perl脚本去除重复的hmmer搜索的转录本ID，多个转录本ID保留一个作为基因的代表

2 解决

5 您好，我想问下如果我的基因家族有两个结构域，两个pfam号，我应该怎么筛选呢？？

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老师您好，我在运行多个基因组共线性时出现报错，mcscan_layout文件里的输入的文件也都正确，在当前目录下，不知道是什么原因

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5 系统进化树构建出的图有问题

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MCScanX基因组之间共线性：ZeroDivisionError: float division by zero

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老师您好，我在运行4个物种共性性关系时出现以下报错，请问该怎么解决

1 解决

motif+进化树+转录本怎么在tbtools上环形显示呀

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kaks使用phy还是出现not equal如何解决

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5 用bHLH的第一个pfam号hmmer搜索不出来,是哪里出问题了？

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5 做基因家族分析上游顺作用原件分析时，启动子序列提取结果现显示如下

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老师请问我想做4个物种间的共线性分析，思路是和3个物种间的一样吗？我不知道该怎样排布这4个物种

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5 挂载共享文件夹，每次打开bio-linux都要重新挂载sudo mount -t……

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老师您好，我想问一下，有没有某一个基因家族在某一物种（不同的的进化过程，比如二倍体，四倍体，六倍体）的文章？谢谢