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基因家族鉴定完后，如何做基因表达？

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我在NCBI上下载的CDS数据，在进行提取基因家族的CDS序列时，提取不出来

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PATL基因家族如何进行鉴定

  • 2019-03-11 09:36
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我在做基因结构分析时，运行完脚本后只出现了mRNA的信息，没有外显子和CDS的信息，请问是为什么？下面的图是我的gff文件和运行脚本后的文件

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进化树

  • 2019-03-05 16:33
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5 关于cd-hit这个去冗余工具参数的一些疑惑

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5 MapChart

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15 蛋白结构域完整性的验证

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5 请问我该怎么去知道我想做的基因家族分析之前有没有人做过，能给点思路吗？

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5 figtree编辑美化进化树的时候bootstrap值怎么是小数呢？

  • 2019-02-28 17:31
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有关基因家族鉴定学习课程的问题：在利用hmmer软件鉴定基因家族成员的过程中，domain脚本运用时需要输入的域值是一定的吗？不是的话是怎么设定呢？（讲解的课程上是1e-20）那之后的将最终生成的txt文件数据复制在表格中进行筛选的域值 （拟南芥筛选的是0.01）跟之前的设定域值有关系吗？

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5 老师，我这儿hmmsearch一直都是这个失败，请问是怎么一回事呢？

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绘制转录本结构图通过gffread提取gtf文件transcript_id后名字错误，请老师指教

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5 片段复制和串联重复

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8 家族基因鉴定

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5 由于我的基因组较大，拆成了每条染色体为一个文件，分别对应提取顺势作用元件的时候tiquxulie.pl脚本出现问题

  • yzf 2019-02-14 11:34
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在学习基因鉴定家族课程中，我尝试做草莓基因Mapk基因家族的鉴定，但在ensembl网站下载有关草莓基因组的数据文件时，未找到相关草莓基因组是怎么回事呢？有什么解决办法吗？

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5 共线性分析

  • 2019-01-31 14:59
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5 如何知道一个motif的功能，或是判断它是哪一个结构域的基序？

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5 请问kaks_calculator 计算分歧时间时Divergence-Time单位是什么呢? 看的文献中都是以 Mya 为单位的数据，而用kaks_calculator 计算的是小数0.0301716