2 回答

有关基因家族鉴定学习课程的问题：在利用hmmer软件鉴定基因家族成员的过程中，domain脚本运用时需要输入的域值是一定的吗？不是的话是怎么设定呢？（讲解的课程上是1e-20）那之后的将最终生成的txt文件数据复制在表格中进行筛选的域值 （拟南芥筛选的是0.01）跟之前的设定域值有关系吗？

1 解决

5 老师，我这儿hmmsearch一直都是这个失败，请问是怎么一回事呢？

2 回答

绘制转录本结构图通过gffread提取gtf文件transcript_id后名字错误，请老师指教

1 回答

5 片段复制和串联重复

2 回答

8 家族基因鉴定

2 回答

5 由于我的基因组较大，拆成了每条染色体为一个文件，分别对应提取顺势作用元件的时候tiquxulie.pl脚本出现问题

  • yzf 2019-02-14 11:34
1 回答

在学习基因鉴定家族课程中，我尝试做草莓基因Mapk基因家族的鉴定，但在ensembl网站下载有关草莓基因组的数据文件时，未找到相关草莓基因组是怎么回事呢？有什么解决办法吗？

1 回答

5 共线性分析

  • 2019-01-31 14:59
2 回答

5 如何知道一个motif的功能，或是判断它是哪一个结构域的基序？

1 回答

5 请问kaks_calculator 计算分歧时间时Divergence-Time单位是什么呢? 看的文献中都是以 Mya 为单位的数据，而用kaks_calculator 计算的是小数0.0301716

1 回答

5 共线性分析

3 回答

5 MCSCANX共线性图代码报错,看了其他提问和回答没能解决。

1 解决

gfff文件的具体意义

2 回答

基因结构

1 回答

5 如果研究的基因家族没有已知的结构域domain怎么办？

  • 2019-01-23 18:04
1 回答

10 为什么我按照其他文献中确定的基因下载下来的基因家族，把这些在序列比对，没有他文章中比对的那么整齐呢，都是相同的基因ID,比对方法也一样，我构建进化树的时候，是按照其他文献中确定的基因直接下载下来和我研究的一块构建吗，还是另有其他的方法

2 回答

如何解决meme-v4.12.0软件下载

1 解决

5 老师，Blastall 报错的问题

1 回答

老师，最近绘制染色体位置的软件都下载不下来了，MapGene2Chrom web v2也用不了，怎么办呢，老师您这里有MapChart的安装包吗？或者还有别的什么方法吗

1 回答

5 ORF (bp) ，domain starteend，Sub-cellular localization和No. of introns怎么找