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关于差异基因表达的问题

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老师您好，请问一下gene location 下面的（+）、（-）表示的是什么呀

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请问geo上的array数据是否可以用DESeq2做差异分析

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10 使用get_gene_length_from_gtf.py脚本统计基因长度时报错

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R语言ggplot2 做气泡图

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如何将unigene的所有基因和我的目的基因进行blast比对，有专门的软件吗，谢谢。

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kegg和GO没有参考物种的教程什么时候出啊

  • Iron 2020-10-16 08:14
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查找不同分组之间差异表达基因报错：没有DESeq2包

  • Iron 2020-10-14 10:14
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合并不同样品表达定量结果all_gene_count.tsv文件出问题

  • Iron 2020-10-13 00:19
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您好 我使用GEO芯片数据课程的 download R文件下载 GSE80751和GPL17692时出现这个提示，运行后面的代码就会报错如图2，请问问题在哪里，怎么解决，谢谢！

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请问GEO芯片数据挖掘课程只适用于芯片数据，还是geo上转录组测序数据都可以用

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参考基因组比对，sam为空

  • Iron 2020-09-29 21:27
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老师，我在做完串联重复以后，发现成对基因互相比较的相似性、比对上的长度、还有其他值不一样是怎么回事（只有一对基因对是一样的）？不一样的怎么选择呢？

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建立基因组索引时gene_length文件出问题

  • Iron 2020-09-25 23:13
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10 请问有没有有关一个“科”物种转录组的汇总研究

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你好，之前看您想用转录组比对基因组数据，不知道是否有结果和方法

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基因组索引

  • Iron 2020-09-20 14:18
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FPKM值的理解困惑：双端测序时，一个fragements的两端都测序，结果是有两个reads，那在计算FPKM定义时，说Fragment的最终数目是Reads的1到2倍之间，不应该是reads是fragements的1-2两倍吗，

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差异基因用p-vaule筛选可以吗？

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GO和KEGG富集分析keytype选择？

  • 荣 2020-09-14 21:41