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老师，我在水稻转录因子文库中筛选出来了一些转录因子，我想预测一下它的下游靶基因，并制作一张调控网络图，不知道如何下手，我买了组学大课堂的那个转录组的课程，但是还是不咋懂，希望老师能帮助一下我，谢谢！

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蛋白质ID如何转换为Gene的ID

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关于RNAseq的docker分析中获取基因长度报错问题

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使用hisat2比对时结果出错

  • 2022-04-21 09:48
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请问下会从三代测序的bam文件中提取想要序列的bam文件吗？

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我按照链接文档安装，但是都失败了。我用我同学的电脑安装一次就成功了。想知道我电脑为什么安装不了的原因。

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sam 转换成bam 格式并排序时，没转换成功。reads 与基因组进行比对map这里出错。

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我是win10家庭版，由于没有Hyper-V所以要先设置一下，但是我在以管理员身份运行Hyper-V文件时，总是会卡在这，一直不变，也没有进度条什么的，试了好几次了，都是这样。

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老师，您好，我的电脑是企业版，但是找不到hyper-v，在dism中找到的好像运行过hyper-v但是后面就被关掉了，在程序与功能中找不到hyper-v，这是为什么呢

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转录组自主分析map出现问题

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老师您好！我要进行小麦基因蛋白互作网络分析，使用小麦与拟南芥找到8对同源基因，后来用Cytoscape进行美化时，要用所找到拟南芥映射小麦，这个映射用VLOOKUP比对时是用的之前找到的8对同源基因即下载的ortho-orthologs文件吗？

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老师您好，我要进行基因蛋白互作网络分析，用小麦与拟南芥找到8对同源基因，后来用Cytoscape进行美化时，要用所找到拟南芥映射小麦，这个映射用VLOOKUP比对是用的之前找到的8对同源基因即下载的ortho-orthologs文件吗？

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哭(´;︵;`)，虚拟机下Linux全屏，不知道怎么回去了，情趣帮忙

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老师，您好。想问一下，我做的基因家族有好几个pfam文件，hmmer搜索后，除去各个文件的重复转录本，最后合并成一个文档。但这个文档还是有重复的转录本，是什么原因造成的呢？

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老师，我想问一下我的无参转录组数据不是全长，它是不是叫cds序列？还有就是找全长序列除了做race还有其他方法吗？

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reads 与基因组进行比对map 是程序正常运行，但sam文件为空，求老师赐教

  • WH 2022-02-18 21:34
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老师，您好，我目前处于GWAS新手状态中，您能叫我下怎么获取数据吗？

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5 如何在Windows PowerShell基因组GFF文件中搜基因的个数呢？比如说在斑马鱼中搜索DMBT1基因，搜到了一个，想搜还有没有这个基因，如何搜下一个呢，怎么操作呢？需要输入什么指令呢？

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那老师有什么办法解决因为内存小无法运行docker这个问题吗？

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5 Linux教学视频的第8个视频，里面有CMD.txt文件，我也没有啊。不知道哪里下载。