0 回答

20 请教一下TCGA的蛋白数据怎么理解，它是有正负值的，这个正负值代表什么意思，为什么蛋白表达会有负值？我只想给它分成高表达，低表达和表达缺失组应该怎么处理呀？

1 回答

40 运行GDCprepare(query, save=FALSE)时错误

1 回答

10 TCGA数据下载完成后，运行prepare代码进行数据整理时报错，如图所示，各位老师如何解决呢？谢谢啦！

  • 2022-04-08 13:14
1 回答

5 老师您好，您之前的文章有一篇《TCGA临床数据各列含义》，有一部分临床数据找不到，请问有没有官方文档可以找到全部临床数据各列含义？

1 回答

10 请问老师有没有"医学癌症TCGA-基因差异表达分析"课程基因表达数据下载后提取癌症组织数据，并用于课程“医学癌症TCGA-生存分析”的代码，感觉跨度有点大。

2 回答

6 老师您好，想请教一个临床数据下载解释问题

1 回答

20 gdcRNADownload(project.id = 'TCGA-CHOL', + data.type = 'RNAseq', + write.manifest = FALSE, + method = 'gdc-client', + directory = rnadir)

1 回答

10 为什么在使用TCGAbiolinks包下载数据时会出现以下问题呢？

1 解决

5 请问为什么我的R怎么都下载不了TCGAbiolinks,下载到了最后总是出现这样的问题？

1 回答

10 老师好！我已经用edgR包分析出TCGA差异表达基因，做火山图可视化的过程中报错，求解答！谢谢！

  • 2020-08-21 19:38
1 回答

5 老师！求解答！在TCGA数据基因ID转换中出错！!

3 回答

50 TCGAbiolinks GDCprepare使用问题 提示找不到文件？

1 回答

30 TCGA中比如说我要下病例报告，slide，还有msi怎么下载?

  • 2020-03-03 09:41
1 回答

100 你好！我参照《医学癌症TCGA-甲基化生存分析》中的方法做甲基化生存分析模型独立性验证时，将患者年龄分为3组分别进行验证，运行代码如图，但是运行后总是报错显示“找不到对象……”请问该如何解决？非常感谢！

2 解决

100 甲基化探针cg号转换为基因名

1 解决

3 TCGAbiolinks使用求助 Downloading genome information (try:0) Using: Human genes (GRCh38.p13) Error: $ operator is invalid for atomic vectors

2 回答

5 处理临床数据时，只有xlsx工作表，没有xlm文件。应该怎么用r处理数据？

1 回答

20 TCGA数据下载完成后，运行prepare代码进行数据整理时，Rstudio总是白屏死机，怎么办？是电脑配制不够吗？

  • 2019-12-01 16:34
1 回答

20 TCGA下载数据更改了工作目录

  • 2019-11-17 10:45
1 回答

5 TCGA生存分析cut off

  • YUE 2019-09-05 13:47