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老师 你好，我通过Git bash利用代码 tcga_gene_exp_download下载数据提示terminate called after throwing an instance of 'std::bad_alloc' what(): std::bad_alloc，无法分析后续数据

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10 请问老师有没有"医学癌症TCGA-基因差异表达分析"课程基因表达数据下载后提取癌症组织数据，并用于课程“医学癌症TCGA-生存分析”的代码，感觉跨度有点大。

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老师，您好，我在用你TCGA课程的cox函数做生存分析，每次通过barcode 提取病人的编号,rowname 转换成病人编号,取barcode 前12位，datExpr里面的barcode 编号分隔符变成“.”，然后合并数据后clin变成了0

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R进行cox生存分析时读入临床数据一直报错

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老师好，R包一直安装失败不知道怎么回事，Bioconductor上的安装出现问题，如图所示（但是加载的话不报错！），还有就是VIP还是没通过呀，我子订单也提交了

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使用R语言无法从TCGA数据库下载数据

1 解决

老师您好！我在做生存分析发现一个基因低表达时os低，但为什么使用ESTIMATE却得到免疫浸润高呢，这是不是不太相符，是不是哪里错了？

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6 老师您好，想请教一个临床数据下载解释问题

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老师您好，我这个为什么把cart加入购物车case的数量变多了？

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老师，学习了TCGA 生存分析，在筛选显著多因素时，multi_pvalue可以调大些吗，最后仅晒出1-2个预测分子，

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在TCGA构建ceRNA网络，数据用代码下载不完全啊

  • YYL 2021-03-11 20:19
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老师好，我有风险模型的问题请教

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老师您好。做GSEA分析图，我在上传文件 的时候。文件名是.gct。出现下图所示这样的错误，请问是什么原因呢?怎么处理？

  • 2021-01-18 11:49
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大家好 有朋自远方来 不亦说乎，请多关照哈

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电脑内存不能升级，运行Rstudio内存一直上升，请问还有其他方法解决这个问题吗。

  • 2020-10-31 09:33
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20 gdcRNADownload(project.id = 'TCGA-CHOL', + data.type = 'RNAseq', + write.manifest = FALSE, + method = 'gdc-client', + directory = rnadir)

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10 为什么在使用TCGAbiolinks包下载数据时会出现以下问题呢？

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5 请问为什么我的R怎么都下载不了TCGAbiolinks,下载到了最后总是出现这样的问题？

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10 老师好！我已经用edgR包分析出TCGA差异表达基因，做火山图可视化的过程中报错，求解答！谢谢！

  • 2020-08-21 19:38
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关于TCGA临床数据中非数值类型的数据如何处理？如图划线部分，这些肿瘤分型数据如何转化为数值，有没有参照的标准，性别这种可以用1,2代替，但类型多的数据如何处理呢？感谢老师!

  • dilf 2020-08-13 17:35