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WGCNA样本必须至少15个吗?
zhuzhuxia
2024-06-16 22:29
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我得到转录组分析的wgcna数据需通过cytoscape筛选关键模块的hub基因,边的权重应该设定多少来筛好
Cytoscape
hub gene
hub基因
WGCNA
小凶饼甘
2024-05-21 00:24
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老师,我有30个经过高氮、低氮处理的转录组数据,但是不清楚我的性状定义是否正确?能指导下吗?谢谢! 图片压缩后总提示太大,不知道是否成功上传
别扒拉我
2024-02-18 23:46
0
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利用代码绘制共表达网络时,有一个聚类最多的基因颜色模块没有导入Cytoscape的两个文件,谢谢老师
阿颜君
2023-07-27 16:42
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我想咨询一下wgcna问题
WGCNA
Iok
2023-06-30 15:52
1
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1484
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样品聚类树图片不显示
fruit611
2023-03-01 10:38
1
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1764
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5
运行WGCNA代码时出现下图报错,下载packageGO.db显示版本不对,是不支持最新版本吗。这一步不解决无法进行下面所有操作,请问老师如何解决
抛抛抛
2023-01-07 10:53
0
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1628
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3
同一个基因出现在WGCNA的不同模块里,red和blue里,哪里错了,请指教
总是那么郁闷
2022-07-24 10:20
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2020
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GSE13015提供的标准化后的表达值有负值,能否直接用来做WGCNA分析,还是要做其他预处理? 请各位老师帮忙解答下,感激不尽!
Dr.zhou
2022-07-21 20:45
1
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老师您好,我在做WGCNA分析时,无法打开'9.Module_membership文件,相关报错截屏和操作文件已发布,请问老师,是哪一步出了问题?该如何解决?谢谢老师。
lncRNA
WGCNA
李承晔
2022-07-21 17:34
1
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WGCNAcor相关系数的选择
WGCNA
2022-07-07 18:15
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参考图片
画图
芳芳花花
2022-07-07 10:55
0
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WGCNA TOM可视化报错
TOM
2022-04-06 13:13
0
回答
2133
浏览
做WGCNA分析,性状数据可以同时有数量数据和分类数据吗?
性状数据
JNDASJDL
2021-10-22 20:26
1
回答
3984
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请问老师我做WGCNA这一步TOM = TOMsimilarity(adjacency);卡主不动。
守得云开雾现。
2021-07-08 20:43
1
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3704
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5
安装WGCNA编辑包出现如下问题怎么解决?
R
白羽
2021-06-19 11:19
1
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3676
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10
WGCNA如何只提取某一模块到Cytoscape中来绘制网络?
模块
网络图
WGCNA
丁子楠
2021-04-19 16:47
1
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2598
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老师你好我在做WGCNA分析时,将癌症样本定义为1,癌旁样本定义为0,同样的代码都是把表型文件以及表达文件以CSV格式输入但是,用另外一组数据出来的结果得到的是性状与模块相关性热图上P值和相关性值全是NA
KASEIA 洪
2021-02-13 13:38
0
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2282
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10
WGCNA中想做一个样本——模块热图,求指教
Trait
elephant
2020-12-17 20:43
1
回答
2433
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5
老师您好,WGCNA power值很奇怪,感谢您的回答!!
萝卜 萝卜
2020-12-11 19:02
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