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3 关于WGCNA模块hub基因筛选的问题

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5 WGCNA运行代码问题sft

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5 WGCNA分析中cluster dendrogram图上的module colors只能显示一种颜色，但在代码中table(moduleColors)显示已分19个模块19种颜色，想问下是哪里出现问题了，谢谢！

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5 wgcna得到模块后如何根据目的基因有关的tom值排序筛选候选基因呢

  • 2019-08-07 05:01
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5 WGCNA分析中，灰色模块基因数若过多是说明划分模块有问题么？

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5 WGCNA分析中，模块保守型分析需要两类样本的基因数目一致么

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5 有关WGCNA去除离群样本

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5 GEO基因差异分析中，数据提取后，进行组间筛选差异基因时，进行上调下调后，为什么没有上调下调基因，都是normal呢？

  • Blue 2019-05-30 20:53
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5 请问各位老师，WGCNA分析中没有性状数据，但分析了两份基因表达数据，我想要得到Module-module relationships的图，应该怎样修改这部分打的代码呢？

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10 (WGCNA) 已有基因模块分析结果，如何将其继续转换成可以用于cytoscape作图的文件？

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5 请问一下大家一个问题，我之前跑WGCNA的时候都没有问题，但今天跑的时候载入R包的时候发生的错误，有谁知道是为什么吗

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5 wgcna 生成文件的CytoscapeInput-nodes-是做什么的呢？

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5 WGCNA中运行代码不出图

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5 在做WGCNA分析时，基因表达数据文件的基因的ID在最后一列，由于数据量很大，改动可能造成数据混乱，所以想请问一下，代码需要做怎么的改动让他识别左后一行才是名称呢？

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5 WGCNA数据格式整理

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5 老师好，学习组学大讲堂WGCNA课程时，按照老师给的代码进行操作，但是Rstudio右下角plots中无图显示，而files中却可查看图片，这是何问题。

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3 到底选哪些样品构建WGCNA

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5 WGCNA分析基因筛选

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5 做WGCNA分析时，modules数量多少时结果较为理想？

  • 2018-11-15 20:38
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5 构建网络是用所有表达基因还是差异基因？

  • 2018-11-12 08:50