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相同材料不同处理之间，可相同材料不同处理之间，可以放在一起做WGCNA分析吗？比如重金属和盐碱处理。

  • 2018-09-13 11:36
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WGCNA分析，前期数据载入Rstudio中出现“error reading from connection”，这该怎么解决？我看到官方网站就是这样的代码。

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WGCNA分析，计算了软阈值，为什么powerEstimate没有提供估计值？

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5 WGCNA分析中，取材是，有5个植物发育时间点，两个品质高低不同的材料，三次生物学重复，也就是三十个样本，请问，针对其中某个材料某个时间点中的一次生物学重复不好的剔除后，影响WGCNA的分析吗？还有就是时间点可以作为一种表型作为输入文件吗？

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WGCNA分析，官网给出的代码中两次计算了dissTOM，两次代码不一样，结果会不会也不一样？

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WGCNA分析中，R语言对邻接矩阵得到β值作图，图中的数字堆到一起了，怎么将它们分开？完全按照课程代码编写的。

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为什么在Rstudio画图不显示？

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WGCNA-MAD

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代码“sampleTree = hclust(dist(datExpr0), method = "average")”中，dist()函数进行哪种聚类？为什么先dist再hclust？两种聚类有什么区别？

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WGCNA分析需不需要进行log转换？

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WGCNA分析，最多能划分几个模块？若一直beta值未达到0.8，怎么办？

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检查数据是否正确

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5 你好，我需要这个特征向量关联图的这部分代码，视频中没有。

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wgcna hub基因

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请问一下：WGCNA分析生成的结果文件8-性状与模块关联关系怎么解读？相关性的高低与基因的表达是什么关系，与后面的关键基因怎么有什么关联呢？

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可以采用差异表达基因进行WGCNA分析吗？