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老师请问，这种OG0000.。。代表的基因家族扩增还是收缩问题，他们的具体名称在哪里对应查找，比如OG000044代表钙粘蛋白基因家族，还是什么家族有名称吗？

2 解决

5 动植物比较基因组分析实操中基因组的版本信息

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如果是基于已知的两个遗传位点，用GWAS分方法的目的是研究这两个位点随时间序列的跟踪，处于这样的目的40个品种够吗，出于这样的目的的话对品种数量有要求吗？

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omicsclass/rnaseq老师目前这个好像没有了，能分享一下本地安装吗？

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5 Mac更换成自己地址后仍然无法打开Docker镜像

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变异结果过滤

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老师，我在做PCA时，显示软件在环境变量中没找到，但是里面显示是有的，请问这是因为什么呢？怎么解决？

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单细胞测序数据做聚类分析后图片聚类结果不清晰且很丑，应该调整哪些参数？怎么调整？

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vcftools无法使用

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iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bnni -alrt 1000 --prefix iqtree出现报错

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老师您好，我按照课程提供的流程泡自己的数据，在构建进化树的时候利用run_pipeline.pl -Xmx200G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这个命令操作的，但生成的supergene里面有好多命名重复，这是怎么回事？由于这个重复就导致我没法做进化树

  • per 2024-06-04 16:19
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使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

  • mike 2024-03-18 18:42
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请问大家我从bioproject下载的sralite文件，转为fastq格式后内容有问号

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为什么docker中cocker search 搜不到omicsclass了

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10 SeparateChromosomes2划分连锁群不合理怎么解决

  • 2024-08-18 17:30
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iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bnni -alrt 1000 --prefix iqtree出现报错

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进化树画图

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nextpolish报错

  • 荣 2024-03-06 23:19
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《微生物宏基因组分析实操》课程，配制分析环境（doc.sh）遇到Bug

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LD衰减分析